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2017 年教育訓練課程


  • 主題 1 :生物資訊之相關應用
  • 主題 2 :電子資源、資料庫、工具及書目管理軟體之使用教學

如何提昇研究競爭力-活用 WOS、JCR、DCI 及 ResearcherID (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 04 日(四)
    09:30 ~ 12:00
  • 主講人: Mr. 林庚賢 (碩睿資訊有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Outline

以新一代的Web of Science加速您的研究探索
1.瞭解最新相關研究動態
2.掌握相關研究之高被引文獻
3.分析相關研究歷年發展趨勢及h-index值
4.追蹤相關研究引用地圖脈絡
5.利用JCR選擇高品質期刊投稿
6.利用ResearcherID提高我的文章曝光率

以Data Citation Index加速研究數據取得及延伸研究資源
1.Data Citation Index收錄內容與特色
2.加速研究數據取得、避免重複實驗研究
3.探索國際 Repositories 與其存放的資料研究、資料集
4.追蹤研究資料與科學文獻連結與資料引用情形


Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 基礎課程 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 09 日(二)
    09:00 ~ 12:00
  • 主講人: Ms. 洪千琇 (創源生技分子視算中心)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Ingenuity Pathways Analysis(IPA)為目前世界上內容最完整、註解最精確的分子醫學分析軟體暨資料庫。其內容是由數百位博士級研究人員,定期研讀且更新數千種知名期刊上所發表之文獻,並整合超過20種第三方生命科學資料庫,以系統生物學原理彙整、建構複雜分子網路。目前許多國際知名藥廠及研究機構皆採用IPA作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、代謝與調控路徑、與疾病等研究之分析與開發工具,至今已輔助許多研究機構發表超過10,000篇專業文獻於知名期刊上,如Nature、Science、Cancer Research、PNAS等。研究人員可藉由IPA搜尋或是上傳實驗資料所得之分析結果,迅速地找出基因、藥物、與生物代謝路徑或致病因子之間的關係,以獲得新知。生物與化學資訊之完美整合,為Omics Era 系統生物學與生命科學研究不可或缺之必備工具。

大綱:

1. IPA 介紹
2. 利用IPA 進行搜尋
3. 使用IPA 進行分子模型建構並繪製訊息傳遞路徑
4. Q & A


Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 基礎課程 (in English) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 09 日(二)
    14:00 ~ 17:00
  • 主講人: Ms. 洪千琇 (創源生技分子視算中心)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Ingenuity Pathways Analysis(IPA)為目前世界上內容最完整、註解最精確的分子醫學分析軟體暨資料庫。其內容是由數百位博士級研究人員,定期研讀且更新數千種知名期刊上所發表之文獻,並整合超過20種第三方生命科學資料庫,以系統生物學原理彙整、建構複雜分子網路。目前許多國際知名藥廠及研究機構皆採用IPA作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、代謝與調控路徑、與疾病等研究之分析與開發工具,至今已輔助許多研究機構發表超過10,000篇專業文獻於知名期刊上,如Nature、Science、Cancer Research、PNAS等。研究人員可藉由IPA搜尋或是上傳實驗資料所得之分析結果,迅速地找出基因、藥物、與生物代謝路徑或致病因子之間的關係,以獲得新知。生物與化學資訊之完美整合,為Omics Era 系統生物學與生命科學研究不可或缺之必備工具。

大綱:

1. IPA 介紹
2. 利用IPA 進行搜尋
3. 使用IPA 進行分子模型建構並繪製訊息傳遞路徑
4. Q & A


Turnitin 論文線上比對系統教育訓練 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 15 日(一)
    10:00 ~ 11:00
  • 主講人: Ms. 黃爽容 (igroup Taiwan)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)
請注意:報名此場次之前,尚未有帳號者,請先申請Turnitin帳號(限院內生命組同仁).請按申請連結

經由Turnitin線上原創比對,了解論文是否有被剽竊? 課程內容如下:
1. Turn it in介紹
2. 啟用帳號:利用啟用信啟用帳號
3. 上傳論文
4. 查看原創性報告

此課程將介紹新版介面,歡迎報名參加!

Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 進階課程 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 16 日(二)
    09:00 ~ 12:00
  • 主講人: Ms. 洪千琇 (創源生技分子視算中心)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Ingenuity Pathways Analysis(IPA)為目前世界上內容最完整、註解最精確的分子醫學分析軟體暨資料庫。其內容是由數百位博士級研究人員,定期研讀且更新數千種知名期刊上所發表之文獻,並整合超過20種第三方生命科學資料庫,以系統生物學原理彙整、建構複雜分子網路。目前許多國際知名藥廠及研究機構皆採用IPA作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、代謝與調控路徑、與疾病等研究之分析與開發工具,至今已輔助許多研究機構發表超過10,000篇專業文獻於知名期刊上,如Nature、Science、Cancer Research、PNAS等。研究人員可藉由IPA搜尋或是上傳實驗資料所得之分析結果,迅速地找出基因、藥物、與生物代謝路徑或致病因子之間的關係,以獲得新知。生物與化學資訊之完美整合,為Omics Era 系統生物學與生命科學研究不可或缺之必備工具。

大綱:

1. 上傳實驗資料並使用 IPA 分析功能
2. IPA 分析結果介紹
3. 比較分析結果的差異
4. Q & A


Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 進階課程 (in English) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 16 日(二)
    14:00 ~ 17:00
  • 主講人: Ms. 洪千琇 (創源生技分子視算中心)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Ingenuity Pathways Analysis(IPA)為目前世界上內容最完整、註解最精確的分子醫學分析軟體暨資料庫。其內容是由數百位博士級研究人員,定期研讀且更新數千種知名期刊上所發表之文獻,並整合超過20種第三方生命科學資料庫,以系統生物學原理彙整、建構複雜分子網路。目前許多國際知名藥廠及研究機構皆採用IPA作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、代謝與調控路徑、與疾病等研究之分析與開發工具,至今已輔助許多研究機構發表超過10,000篇專業文獻於知名期刊上,如Nature、Science、Cancer Research、PNAS等。研究人員可藉由IPA搜尋或是上傳實驗資料所得之分析結果,迅速地找出基因、藥物、與生物代謝路徑或致病因子之間的關係,以獲得新知。生物與化學資訊之完美整合,為Omics Era 系統生物學與生命科學研究不可或缺之必備工具。

大綱:

1. 上傳實驗資料並使用 IPA 分析功能
2. IPA 分析結果介紹
3. 比較分析結果的差異
4. Q & A


動物與植物的對話- 如何善用生圖資料庫 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 18 日(四)
    09:00~12:00
  • 主講人: Mr. 張克群 (飛資得知識服務股份有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)


Outline

09:00~09:50 ProQuest Natural Science

ProQuest資料庫簡介
農業與環境科學相關領域
水產/漁業,地質學,氣象學/太空物理學相關領域
生物科學相關領域
操作指引
實例展示


10:00~10:50 JSTOR Global Plants
JSTOR Global Plants 資料庫簡介
關於GLOBAL PLANTS
Global Plants的優點及特色
收錄來源(合作夥伴)
操作指引
實例展示

11:00~11:50 BioOne
BioOne介紹:為您帶來生物、生態及環境科學的一流研究
操作說明
瀏覽
檢索、檢索結果
圖片檢視、手機版
研究者相關工具
設定個人帳號
文章工具
客製化通知
儲存檢索


Turnitin 論文線上比對系統教育訓練 (in English) 問卷圖檔

  • 上課日期: 05 月 19 日(五)
    10:00 ~ 11:00
  • 主講人: Mr. 陳定遠 (igroup Taiwan)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)
請注意:報名此場次之前,請先申請Turnitin帳號(限院內生命組同仁).請按申請連結

經由Turnitin線上原創比對,了解論文是否有被剽竊? 課程內容如下:
1. Turn it in介紹
2. 啟用帳號:利用啟用信啟用帳號
3. 上傳論文
4. 查看原創性報告

此課程將介紹新版介面,歡迎報名參加!

Arrays or RNA-Seq? Choosing the right tool for your research(in Chinese)

  • 上課日期: 05 月 24 日(三)
    15:00-16:30
  • 主講人: 林啟銘(Technical Sales Specialist, Thermo Fisher Scientific)
  • 上課地點:中央研究院農業生物科技大樓A134
RNA-seq被認為是發現新基因的有效方法,但此技術還是有其局限性。當研究人員欲進行低表現量基因以及Isoform的偵測時,往往需要提高測序的深度。雖然測序深度的提高可以增加資料的準確性,但卻造成經費以及分析難度的增加。
演講內容:
探討RNA-Seq與Microarray的差異
介紹新一代晶片Clariom™D assays,能快速獲得coding及non-coding RNA的分析結果以及Isoform的偵測
介紹分析軟體的新功能

如何提昇研究競爭力-活用 WOS、JCR、DCI 及 ResearcherID (in English) 問卷圖檔

  • 上課日期: 06 月 01 日(四)
    09:30 ~ 12:00
  • 主講人: Ms. 柯佳伶 (碩睿資訊有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Outline

以新一代的Web of Science加速您的研究探索
1.瞭解最新相關研究動態
2.掌握相關研究之高被引文獻
3.分析相關研究歷年發展趨勢及h-index值
4.追蹤相關研究引用地圖脈絡
5.利用JCR選擇高品質期刊投稿
6.利用ResearcherID提高我的文章曝光率

以Data Citation Index加速研究數據取得及延伸研究資源
1.Data Citation Index收錄內容與特色
2.加速研究數據取得、避免重複實驗研究
3.探索國際 Repositories 與其存放的資料研究、資料集
4.追蹤研究資料與科學文獻連結與資料引用情形


見微知著 - 利用Pathway Studio Plant 探索實驗資料中蘊藏的生物意義 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 06 月 09 日(五)
    14:00 ~ 16:30
  • 主講人: Ms. 洪千琇 (創源生技分子視算中心)
  • 上課地點:農科大樓A134會議室
Pathway Studio承襲了Elsevier出版商的資料優勢,擁有世界上涵蓋範圍最廣泛且多樣的系統生物學資料庫內容。Pathway Studio根據使用者需求分成MammalPlant版本,其中Pathway Studio Plant專為植物科學家設計,整合了巨量生物分子間交互作用資料及視覺化分析工具,協助科學家了解分子間的交互作用及生物過程的因果關係,可應用於探討植物保護、育種及作物產量的生物學原理。Pathway Studio Plant以阿拉伯芥、玉米、稻米為模式生物,內建許多條訊號路徑與代謝路徑。此外,您可以匯入各種基因表現數據或單體(Entity)列表,與現有期刊文獻或未發表資料的代謝路徑做比對,並以圖形呈現分析結果,協助您發覺實驗資料內蘊藏的生物意義。

微陣列基因表達資料分析實務 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 06 月 13 日(二)
    09:00~17:00
  • 主講人: Dr.劉力瑜 (副教授, 台灣大學農藝所)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

請自行攜筆電前往參加。(筆電請先安裝好 R軟體 及 BioConductor)

Outline:


09:00-12:00 Data preprocessing and hypothesis testing via AffylmGUI

14:00-17:00 Gene set analysis and network analysis

您可信賴的實驗室食譜 (in Chinese) 問卷圖檔

  • 上課日期: 06 月 16 日(五)
    10:30 ~ 11:30
  • 主講人: Mr. 程世仁 (Senior Account Manager, Wiley)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

Outline

什麼是實驗室指南?
在自然科學中,實驗室指南是事先定義的書面程序方法,用來將實驗室方法用在實驗室中,並保證成功複製研究結果。

什麼是Current Protocols?
27年來Current Protocols一直都是最可靠的實驗室參考資源,目前推出17種包含17000多種技術程序。
簡言之,Current Protocols就是科學家或是研究人員在實驗室的可靠食譜,他提供了詳細的步驟、器材清單、成份清單、可能遇到的問題,還有計算器、問題解決和說明為什麼,甚至還有圖表和影片,重點是內容都來自全世界最頂尖的研究室,再經同儕評鑑審查後才出版,重要性不可言喻!


細菌基因體組序及註解- 以鉤端螺旋體菌之分析為例(in Chinese)

  • 上課日期: 07 月 11 日(二)
    14:00~16:00
  • 主講人: Dr. 陳亭妏 (助理研究員, 長庚大學 分子醫學研究中心)
  • 上課地點:生醫所B1A會議室

在定序技術不斷進步下,解序細菌基因體不再遙不可及,然對於細菌基因體內之大片段的重覆序列,依舊不是短序列定序的二代定序技術可以解決的,在此課程中我們將介紹解基因體的方法,並利用鉤端螺旋體為例介紹結合次世代定序、三代定序技術完整解出細菌基因體,亦將介紹、分享後續細菌基因體註解之工具。


CLC bio Genomics workbench workshop (in Bilingual)

  • 上課日期: 07 月 24 日(一)
    09:30 ~ 16:30
  • 主講人: Mr. 王昀珩 (Sales & Support, CLC bio Asia-Pacific)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

生圖並未訂購此軟體報名人數眾多,將採以一實驗室為單位優先錄取。


A Practical Guide to The Arabidopsis Information Resource (TAIR) (in Bilingual)

  • 上課日期: 08 月 01 日(二)
    10:00 ~ 12:00
  • 主講人: Dr. 陳荷明 (助研究員, 農生中心)
  • 上課地點:農科大樓A134會議室

Since the Arabidopsis genome was finished in year 2000, the information derived from intensive studies of this plant model organism has been accumulated rapidly. The Arabidopsis Information Resource (TAIR) is a database providing comprehensive and up-to-date genetic and molecular biology data of Arabidopsis on a genome-wide scale.
This workshop will demonstrate how to interpret, retrieve and analyze various data types with the use of TAIR.
1. DNA analysis: cis-element, polymorphism, DNA methylation
2. RNA analysis: splicing, expression, plant ontology, small RNA, degradome
3. Protein analysis: domain, localization, modification, protein-protein interaction
4. Function analysis: gene ontology
5. Pathway analysis: AraCyc Pathways
6. Others: seed stock, ftp download


EndNote X8 (in Chinese)

  • 上課日期: 09 月 07 日(四)
    09:30 ~ 12:00
  • 主講人: Ms. 柯佳伶 (碩睿資訊有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

EndNote是目前全球最受歡迎的書目管理軟體,可輕鬆匯入或建立參考書目,協助使用者有效管理所搜集到的參考文獻。在寫作的同時,使用者可搭配Cite While You Write功能,輕鬆引用書目與產生參考書目格式,免於格式編修的困擾,加速發表流程,歡迎前來參加課程!

Outline

  • 安裝說明與工具介面介紹
  • 匯入書目文獻
  • 群組分類管理
  • 寫作功能搭配
  • 資料備份與分享
  • 含實作練習

Mendeley - 文獻管理及學術評鑑工具 (in Chinese)

  • 上課日期: 09 月 19 日(二)
    10:00 ~ 12:00
  • 主講人: Mr. 唐允中 (Elsevier)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

1.匯整從圖書館館藏目錄、資料庫、電子期刊、網路資源等管道蒐集而來的資料。
2.將蒐集到的資料便利地搜尋與分類管理。
3.與論文撰寫結合,簡化引用與撰寫參考文獻格式的作業,可利用 CSL Editor建立新的文獻格式。
4.將書目、全文、個人閱讀筆記等各種相關檔案作串連。 可註記、強調和加標簽在您下載的檔案中。
5.具研究社群功能,您可建立私人或受邀群組和您的研究小組、實驗室成員或班上同學分享文章和註記。
6.您可在Mendeley閱讀的新議題,發現正在進行的研究,追蹤書目,並參與公開群組的討論。

EndNote X8 (in English)

  • 上課日期: 10 月 17 日(二)
    09:30 ~ 12:00
  • 主講人: Ms. 柯佳伶 (碩睿資訊有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

EndNote是目前全球最受歡迎的書目管理軟體,可輕鬆匯入或建立參考書目,協助使用者有效管理所搜集到的參考文獻。在寫作的同時,使用者可搭配Cite While You Write功能,輕鬆引用書目與產生參考書目格式,免於格式編修的困擾,加速發表流程,歡迎前來參加課程!

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  • 安裝說明與工具介面介紹
  • 匯入書目文獻
  • 群組分類管理
  • 寫作功能搭配
  • 資料備份與分享
  • 含實作練習

EndNote X8進階課程 (in Chinese)

  • 上課日期: 11 月 02 日(四)
    10:00 ~ 12:00
  • 主講人: Mr. 林庚賢 (碩睿資訊有限公司)
  • 上課地點:人文館遠距會議室 (3F)

EndNote是目前全球最受歡迎的書目管理軟體,可輕鬆匯入或建立參考書目,協助使用者有效管理所搜集到的參考文獻。在寫作的同時,使用者可搭配Cite While You Write功能,輕鬆引用書目與產生參考書目格式,免於格式編修的困擾,加速發表流程,歡迎前來參加課程!

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  • 匯入書目文獻
  • 群組分類管理
  • 寫作功能搭配
  • 資料備份與分享
  • 含實作練習