教育訓練課程

IPA基礎教育訓練 (in English)

  • 日期: 09 月 10 日 一
    14:00 ~ 16:30
  • 主講人: Ms. 蔡宜庭 (工程業務專員, 創源生技分子視算中心)
  • 地點:人文館遠距會議室 (3F)
QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA )生物路徑分析軟體包含可信的資料來源及分析演算法,為目前全球系統生物學與訊息路徑分析領導品牌,不僅廣泛地被許多科研團體採用,在許多學術期刊中也大量地被引用。

在IPA資料庫中,其資訊為每周更新,並在分析結果提供原始文獻出處,且其文獻資訊為博士級人員人工閱讀,從而提供最正確最詳盡的生物學數據分析解決方案。而在實驗結果分析或是分子搜尋上,IPA不僅能演示單一變因實驗之分子調控,也能整合不同細胞層級之分析數據,如RNA-seq、miRNA和SNP之實驗資料、代謝體學分析及蛋白質體學分析等,讓您在完整的生物系統背景下識別新的目標基因或候選生物標記,顯現出“體學數據” 之重要性。
在IPA生物路徑分析軟體當中,其分析功能可分為資訊查詢以及數據分析服務,在查詢的部分,您可以透過IPA收錄的數百萬筆生物資訊,快速尋找您感興趣的基因、疾病及分子調控方式。而在分子數據意義分析上,IPA提供多樣的分析與結果表示方式,包含生物訊息核心分析(Core Analysis),使用者可將實驗中的基因體、轉錄體或者蛋白質體資料上傳至IPA,並且透過篩選工具選擇出關注分子,利用IPA尋找相關的生物路徑或者疾病與細胞功能。而比較分析(Compare Analyses) 可利用Heatmap同時瀏覽多筆資料的,將結果進行全面性的比較。

Open Access與投稿陷阱 (in Chinese)

  • 日期: 09 月 11 日 二
    10:00 ~ 11:30
  • 主講人: Dr. 黃舒宜 (專案助理研究員, 臺灣大學醫學院附設醫院醫學研究部)
  • 地點:生醫所B1B會議室

大綱

I. 什麼是Open access

1.知識的成本

2.Open Access的成長

3.Creative Commons 授權

4.Open Access模式

5.APC Price list和出版成本

6.誰來付帳?

7.New business models: 會員制/付錢給作者

II.Open Access 衍生出來的問題

1.Hijacked Journals

2.Predatory journals and publishers

3.科學家的逆襲(一): Conference abstract

4.科學家的逆襲(二): Fake papers

5.科學家的逆襲(三): Join the editorial board

6.科學家的逆襲(四): Create your own journal

7.“The List”: Beall’s list, DOAJ, India, Cabell’s lists.

III. 失落的影響因子

1.Medicine的跌停板

2.Oncotarget

3.Oncogene

IV. Mega Journals

1.定義和特色

2.Review Guidelines

3.2012-2017刊登的文章數比較

4.多層次出版模式

5.劣質OA出版的影響

V. 結語: Open Access, Open Science

生命組演講公告
講題:When CRISPR/cas9 meet BAC in mouse : integrated genome-modification technologies
主講者:蔣思澈, Ph.D. (Scientist, National Laboratory Animal Center, National Applied Research Laboratories, Associated Professor (Jointly Appointed) Institute of Clinical Medicine, National Cheng Kung University)
時間:2018年9月4日(星期二) 上午11時
地點:生醫所地下室B1A會議室
主持人:Dr. 黃怡萱 (生醫所長聘副研究員)
講題:Full Genome Analysis: Approach and Applications
主講者:Dr. 郭沛恩 (中央研究院院士, 生醫所特聘研究員兼所長) 時間:107年9月5日(星期三)下午3時
地點:本院基因體研究中心1樓演講廳
講題:The Conventional and Unconventional Autophagy Pathways in Regulation of Hepatocellular Carcinoma and Diabetes Mellitus
主講者:Dr. Shan-Ying Wu (Postdoctoral Fellow, Department of Microbiology and Immunology, National Cheng Kung University)
時間:2018年9月5日(星期三) 下午4時
地點:農業科技大樓A134會議室
主持人:Dr. 徐麗芬 (農生中心特聘研究員)
講題:Adenosine A2A Receptor in the Dorsomedial Striatum Regulates Context-Dependent Goal-Directed and Ethanol Seeking Behaviors
主講者:Doo-Sup Choi, Ph.D. (Professor of Pharmacology and Psychiatry, Director of the Samuel C. Johnson Genomics of Addiction Program, Mayo Clinic College of Medicine)
時間:2018年9月7日(星期五) 上午11時
地點:生醫所地下室B1B會議室
主持人:Dr. 陳儀莊 (生醫所特聘研究員)
講題:Cardiac development and regeneration in zebrafish and medaka
主講者:Didier Stainier, Ph.D. (Professor, Director and Principal Investigator, Max Planck Institute for Heart and Lung Research, Bad Nauheim, Germany)
時間:2018年9月10日(星期一) 上午11時
地點:生醫所地下室B1C會議室
主持人:Dr. 謝清河 (生醫所研究員)
講題:Molecular and Cellular Mechanisms in Dendrite Morphogenesis
主講者:Dr. Cheng-Ting Chien
時間:2018年9月11日(星期二) 上午11時
地點:分生所1樓演講廳
主持人:Dr. 呂俊毅 (分生所研究員)
講題:Targeting Metabolic Addictions of Cancers
主講者:龔行健 院士
時間:107年9月12日(星期三)下午3時
地點:本院基因體研究中心1樓演講廳
講題:So you have Ph.D. and Postdoc experiences, then what? Panel discussion on career options
主講者:葉昱瑩 博士、楊晴惠 博士、張瑞仁 博士、陳俊叡 博士
時間:107年9月13日(星期四)下午3時
地點:本院基因體研究中心1樓演講廳
講題:Oxygenic photosynthesis beyond the red-edge of visible light: photoacclimation of cyanobacteria to far-red light and chlorophyll f synthesis
主講者:Dr. Ming-Yang Ho (Postdoctoral Researcher, Pennsylvania State University, USA)
時間:2018年9月13日(星期四) 下午4時
地點:農業生物科技研究中心農業科技大樓1樓A133會議室
主持人:Dr. 常怡雍 (農生中心研究員兼代理副主任)
講題:Identifying Regulators and the Regulatory Network of C4 Leaf Development Using Laser-Capture Microdissection
主講者:劉文裕博士 (生多中心博士後研究)
時間:2018年9月14日(星期五) 下午3時45分
地點:跨領域科技研究大樓1 樓演講廳
主持人:李文雄特聘研究員
講題:From Data-Dependent to Data-Independent Acquisition: the approaches of quantitative proteomics to study plant biology
主講者:范凱亭博士 (陳逸然博士實驗室)
時間:2018年9月17日(星期一) 上午10時30分
地點:農業科技大樓1樓A134演講廳
主持人:Dr. 陳逸然博士(農生中心研究員兼代理副主任)
講題:The Wide Wild World of HDAC-The Complexity and Promise of Acetylation Biology
主講者:Dr. Tso-Pang Yao
時間:2018年9月17日(星期一) 上午11時
地點:分生所1樓演講廳
主持人:Dr. 李秀敏 (分生所特聘研究員)
講題:Phytochrome diversifies the proteome through alternative promoter selection to confer adaptability to fluctuating light conditions
主講者:Dr. Tomonao Matsushita (Faculty of Agriculture, Kyushu University, Fukuoka, Japan)
時間:2018年9月17日(星期一) 下午3時
地點:農科大樓A134
主持人:Dr. 涂世隆 (植微所副研究員)
講題:Molecular mechanisms causing a variety of secondary metabolites in plants
主講者:Dr. Kousuke Hanada (Department of Bioscience and Bioinformatics, Kyushu Institute of Technology, Fukuoka, Japan)
時間:2018年9月17日(星期一) 下午4時
地點:農科大樓A134
主持人:Dr. 涂世隆 (植微所副研究員)