試用期間:即日起至 10/04 日止
特色簡介:
MarinLit是一個和海洋海生航海相關的資料庫,在1970年代由一所位於紐西蘭的University of Canterbury(網路查詢中文暫譯坎特伯雷大學)的兩位海洋海生自然相關背景的教授 John Blunt and Murray Munro所創立。這個資料庫提供海洋海生自然產品的研究者,一個獨特的搜尋模式和強大的反複製(去重複化)的工具。資料庫內容涵蓋自西元1983年海洋海生自然產品相關的期刊文獻,包含新的或是修正校定過的化合物、合成物、生態環境學和生物學

Protein Data Bank (PDB) (in Bilingual)

  • 日期: 09 月 18 日 四
    10:00~12:00
  • 主講人: Ms. 孫慶姝 (生醫所)
  • 地點:生醫所B1A會議室

Outline

The PDB archive contains all the information about 3D structures of proteins, nucleic acids and complex assembles. This lecture intends to demonstrate how to obtain and analyze structure information from this magnificent resource.

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  Structure comparison
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CLC bio Genomics Workbench v7.5 workshop (in Bilingual)

  • 日期: 09 月 26 日 五
    09:00 ~ 16:00
  • 主講人: Mr. 王昀珩 (Sales & Support, CLC bio Asia-Pacific)
  • 地點:人文館遠距會議室 (3F)

生圖並未訂購此軟體報名人數眾多,將採以一實驗室為單位優先錄取。

CLC bio is the world's leading bioinformatics solution provider. Next Generation Sequencing is a major focus area and CLC bio delivers the first and only comprehensive cross-platform analysis solution, which can analyze and visualize genomic, transcriptomic, and epigenomic data from all major platforms, like Illumina GA / MiSeq / Hiseq, Ion Torrent / Proton by Life Technologies, 454 by Roche. In this workshop, you will get familiar with our software and handle NGS data for re-sequencing / de novo / RNA-seq & ChIP-seq projects.

9:00-9:45 Software Introduction:

Installation & Functionalities in CLC bio Genomics workbench

9:45-10:30 Reference mapping (Resequencing)
Import NGS data
Download genome / reference
Mapping

10:30-10:45 Break
10:45-12:00 Resequencing analysis

Variant detection (SNP, InDel, Coverage analysis)
Track tools
Workflow

13:00-14:00 RNA-seq analysis
14:00-15:00 Small RNA analysis
15:00-15:30 Q & A

Ingenuity Pathways Analysis (IPA®) 基礎課程 - 系統生物學在生醫研究上之最佳應用 (in Chinese)

  • 日期: 09 月 29 日 一
    09:30 ~ 12:00
  • 主講人: Mr. 郭育倫 (IPA Certified Analyst)
  • 地點:人文館遠距會議室 (3F)
★Introduction and Getting Started in IPA (~30 min)
★Searching and Accessing the Knowledge Base (~30 min)
★Practice and Q&A (~15 min)
★Building Pathways (~40 min)
★Editing a Pathway for Publication (~ 20 min)
★Practice and Q & A (~15min)

Ingenuity System, Inc. 為世界領先的專業生物知識提供者,旗下所推出的Ingenuity Pathways Analysis (IPA)為目前世界上內容最完整、註解最準確的生物醫學分析研發軟體暨資料庫。IPA能夠幫助您分析解釋基因表現、microRNA、SNP微陣列資料、或是代謝體、蛋白質體、和RNA-Seq實驗的研究結果。此外IPA也可應用於小量基因或是化合物列表分析,幫助您了解特定族群的網絡關係。IPA資料庫- Ingenuity® Knowledge Base,其內容是由數百位博士級研究人員,提供分析與註解數千種知名期刊上發表之文獻,再加上多種第三方生命科學專業資料庫的內容,以系統生物學之原理所彙整、統合出之龐大網路關係。包括物種、組織、細胞、體液、生物與化學分子等之間的關係都涵蓋其中。許多國際藥廠及研究機構皆採用IPA來作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、及代謝與調控路徑等研究之分析與開發工具,迄今引用IPA為研究工具之期刊文獻已超過10000多篇,其中包括Cell、Nature、Cancer Research、PNAS等。
【欲閱讀更豐富內容,請參閱科學人2014年第151期9月號】
8/20- Microarray and NGS data Analysis workshop (in English)
9/5- 【臺灣人體生物資料庫-資料釋出】說明會 (in Chinese)
9/11- microRNA databases and bioinformatics tools (in Chinese)
講題:竹類植物的進化和功能基因組學研究
主講者:郭振華博士 (中國科學院昆明植物研究所研究員)
時間:2014年9月16日(星期二) 上午10時30分
地點:農業科技大樓1樓A134演講廳
講題:Acute lymphoblastic leukemia: the role of carbohydrate-based interactions on drug resistance
主講者:Dr. Nora Heisterkamp (USC)
時間:2014年9月16日(星期二) 上午11時
地點:生醫所地下樓B1B會議室
講題:Determinants and the Cellular Memory in Transcriptional Positive Feedback Systems
主講者:Dr. Chieh Hsu Postdoctoral fellow (Becskei group), Biozentrum, University of Basel, Switzerland
時間:2014年9月17日(星期三) 上午11時
地點:生化所114室
講題:TBA
主講者:Prof. Kazuyuki Kuchitsu (Department of Applied Biological Science, Tokyo University of Science, Japan)
時間:2014年9月18日(星期四) 下午15時
地點:農科大樓 A134會議室
講題:Chemical Synthesis of Homogeneous Glycoprotein for Elucidation of Oligosaccharide Functions
主講者:Dr. Yasuhiro Kajihara (Osaka University, Japan)
時間:2014年9月22日(星期一) 下午15時
地點:基因體中心1樓演講廳
講題:The PUF Protein Puf3 Toggles the Translational Fate of Bound mRNA Transcripts to Regulate Mitochondrial Biogenesis
主講者:Mr. Chien-der Lee
時間:2014年9月23日(星期二) 上午11時
地點:分生所1樓演講廳
講題:Biology of Chaetognaths
主講者:後藤太一郎教授(日本三重大學教育學部理科教育講座)
時間:2014年9月24日(星期三) 下午16時
地點:跨領域科技研究大樓 1 樓演講廳
講題:Lipid-Calcium-Phosphate (LCP) Nanoparticles for Drug and Gene Delivery
主講者:Dr. Leaf Huang (Fred Eshelman Distinguished Professor, Eshelman School of Pharmacy, University of North Carolina at Chapel Hill, USA)
時間:2014年9月29日(星期一) 上午11時00分
地點:細生所1樓演講廳
主講人:謝道時院士(本院細胞與個體生物學研究所特聘研究員兼所長 )
主持人:本院陳建仁副院長
時 間:103年9月27日(星期六)下午2時至4時
地 點:本院學術活動中心2樓第1會議室
日期:2014年 10月 8日(星期三)
時間:09:30 AM – 04:40 PM
地點:集思台大會議中心蘇格拉底廳
地址:台北市羅斯福路4段85號B1
日期: 2014/9/29 10:30-11:40
地點: 中研院物理所一樓演講廳