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全新火山圖表，讓分析更輕鬆精準設定
在進行核心分析設定時，現已提供全新的火山圖表，使您更輕鬆地視覺化數據集並設定更精確的分析截點。該功能讓您能夠以分子名稱標記感興趣的分子，並將圖表匯出，以在出版物和演示中展示您的差異表達數據的幅度和重要性。
圖1 核心分析中設定可以產出火山圖：該數據集中的綠色點表示低度表現基因，紅色點表示高度表現基因。灰色點為未通過數值截點或 且生物篩選器的基因。
為了使圖表有呈現的空間，核心分析設定視窗已分為兩個分頁。數值截點和圖表位於預設的主要截點分頁 (Set Cutoffs) 上，而您之前使用過的其他篩選器和設定已移至名為生物篩選器 (Biological Filters) 的第二個分頁。
在網路和路徑上利用便利的節點摘要更高效率工作！
透過全新的節點摘要面板，您可以迅速且輕鬆地查看網路或路徑上感興趣節點的摘要詳細資訊。對於感興趣的節點，雙擊 後 打開側邊面板。該面板是在 2023 年 10 月釋出的關係摘要面板的補充。圖2 展示了 Bardet-Biedl綜合症訊號路徑（BBSome Signaling Pathway），點選INSR後，側邊欄將展示該基因的Entrez Gene資訊、基因別名、蛋白結構域、基因所在的訊號路徑等詳細資訊。
圖2 右邊平台顯示新的節點摘要 ：左邊平台顯示路經與網路，點擊任何節點可獲得重要詳細資訊。
圖３側邊面板中的標準路徑連結：當您在右側邊欄中看到基因所在的某個通路時，您可以直接點選該路徑，將會在新的視窗或選項中打開相應的路徑，並在其中 以有顏色亮點標示 感興趣的節點，即使該節點位於一個組或複合物中，並且在路徑圖上沒有明確命名。
若您點擊路徑中嵌入的路徑節點（圖4 ），該面板將顯示一個名為 互動網路 (Interaction的新連結。點擊此連結將打開一個新的 互動網路 視窗，並顯示與該路徑 圖為 PI3K/AKT訊號路徑)相連的所有分子成員（顯示為中央節點）。
圖４側邊面板中標準路徑節點的互動網路連結：該路徑的所有分子成員（包括屬於組或複合物的分子）都將在新的互動網路視窗中打開，並連接到中央的路徑節點。
探索miRNA 數據集的上游調控因子和因果網路
IPA現在可以預測成熟 microRNA 表達資料 集 的上游調節因子與因果網路的活化或抑制。如圖 5顯示 AGO2作為被活化的上游調控因子，上調miR-7-5p、miR-130a-3p、miR-17-5p等microRNA的表達。
圖5 成熟 miRNA 資料的上游調控因子 這個例子為 AGO2 作為被 活化 的上游調控因子，詳情請見下圖。
圖６預測 AGO2 將被 活化 ：數據集中與 AGO2 相關的 miRNA 目標與其相連，並排列在其周圍。正如圖例中所示，除了一個以黃線標示的 miRNA 目標外，其他目標的差異表達方向與 AGO2 的 活化 一致。
記住選擇的資料夾，提高工作效率
現在，在Ingenuity Pathway Analysis（ IPA® ）中，當您選擇保存、複製、上傳、移動或匯出任何專案文件夾，或是電腦中的任何文件夾時，您的選擇將在 IPA 會話期間保持。在該會話中下一次進行匯出、複製等操作時，系統將記住該位置，您無需再次導航或重新選擇。
更新分析匹配資料集元數據
針對即將在此版本中進行更新的Lands HumanDisease 、 MouseDisease 和 OncoHuman ，預計於 2024 年 1 月發布），您可以輕鬆追蹤 OmicSoft 為 IPA 版本新增的分析。我們為這些 La nds 的所有 OmicSoft 數據集新增了一個名為 “ oslandeddate”（簡稱 “OmicSoft 登陸日期 ””）的新元數據屬性。這一屬性中的數值表示數據集經由 OmicSoft 進行整理和發布的時間。最新的登陸日期被標記為 2023R3 ，將於 2024 年 1 月顯示在 IPA 中。在 2024 年 3 月 /4 月的 IPA 版本中，我們將為所有 Lands 的比較更新此日期。
Content updates 內容更新
8個全新信號路徑
• BBSome Signaling Pathway
• Folate Signaling Pathway
• HEY1 Signaling Pathway
• IL-27 Signaling Pathway
• Sleep NREM Signaling Pathway 非快速動眼期(NREM)睡眠訊號路徑
• Sleep REM Signaling Pathway 快速動眼期(REM)睡眠訊號路徑
• UFMylation Signaling Pathway • WNT/SHH Axonal Guidance Signaling Pathway
2個現有的路徑已更新，包含活動模式
- Eicosanoid Signaling Pathway 類二十烷酸 訊號路徑
- Gap Junction Signaling Pathway 間隙連接訊號路徑