GOEAST 相較於其他 GO 分析網站的優點
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GOEAST 方便操作
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分析的物種相當廣泛
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分析的來源除了能上傳基因列表(Gene List) 外，更能上傳 Microarray probe ID
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結果的呈現簡單易懂，以流程圖表示三大類 Biological Process、Cellular Component、Molecular Function 的上下游關係
在此以 Gene List 為例, 為各位介紹如何操作 GOEAST 的流程
http://omicslab.genetics.ac.cn/GOEAST/php/batch_genes.php
Step1: 先選擇分析物種
Step2:選擇正確的基因格式後上傳 (在此以 Gene Symbol 為例)
Step3: 使用預設值, 接著輸入e-mail後, 就可按下 “start analysis”
分析完成的畫面
Gene Ontology 分析結果
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Overlook of Enriched GO Terms
以流程圖形表達結果, 可分別觀看 Biological Process、Cellular Component、Molecular Function 三大類的上下游關係
( 擷取部分結果 )
Detail information
包含三大類的全部結果
( 擷取部分結果 )
若是對 GOEAST 網站的分析有興趣或是對結果有疑惑，歡迎至分生所生物資訊室討論
謝謝分生所Dr.徐唯哲提供