中央研究院生命科學圖書館 -- 生命組重要研究

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重要發現與突破

生醫所（5）

張雅貞 CHANG, YA-JEN

Science Translational Medicine

07 June 2023

嗜中性球胞外誘捕網及CCL4L2是影響氣喘類固醇治療效果的關鍵

李永凌 LEE, YUNGLING

Science Translational Medicine

7 June 2023

嗜中性球胞外誘捕網及CCL4L2是影響氣喘類固醇治療效果的關鍵

王宜萱 WANG, I-HSUAN

Molecular Therapy

08 September 2023

開發廣效型抗體藥物對抗變種新冠病毒

謝清河 HSIEH, PATRICK C.H.

Circulation

21 Sep 2023

人類心肌再生在恆河猴心肌梗塞治療模式中取得突破

陶秘華 TAO, MI-HUA

Molecular Therapy

08 September 2023

開發廣效型抗體藥物對抗變種新冠病毒

生化所（3）

吳昆峯 WU, KUEN-PHON

ACS Synthetic Biology

09 August 2023

人工智慧工具加速蛋白質設計與提升酶活性

陳佩燁 CHEN, RITA PEI-YEH

Nature Communications

06 September 2023

以冷凍電子斷層掃描呈現抗菌胜肽破壞細菌膜的機制

陳瑞華 CHEN, RUEY-HWA

Molecular Cell

16 October 2023

泛素化之PAICS與UBAP2結合誘導相位分離促使嘌呤體組裝

農生中心（7）

何承訓 HO, CHENG-HSUN

Heliyon

發現ＣＩＰＫ15調控植物避免因淹水造成銨肥毒性的作用機制

何承訓 HO, CHENG-HSUN

Bio-protocol

20 August 2023

如何利用新發明的螢光偵測器偵測活體植物中的硝酸鹽

常怡雍 CHARNG, YEE-YUNG

Plant Cell

22 October 2022

維持植物的非生物逆境記憶：從熱順應研究中所學到的事

林于鈴 LIN, YU-LING

Journal of Experimental & Clinical Cancer Research

21 April 2023

植物半乳醣脂活化抗腫瘤體液免疫以治療大腸癌

邱子珍 CHIOU, TZYY-JEN

雙股微型核糖核酸miR399劑量依賴性的長距離移動以調節阿拉伯芥的磷酸鹽恆定

邱子珍 CHIOU, TZYY-JEN

結合全轉錄體關聯性與表現數量性狀基因座之分析以揭示了阿拉伯芥基因表達與開花的遺傳聯繫性

陳逸然 CHEN, YET-RAN

Nature Communications

04 August 2023

XCP1將致病蛋白一號轉化成全身防禦細胞素CAPE9，有效啟動阿拉伯芥的全身性免疫反應

分生所（3）

夏國強 HSIA, KUO-CHIANG

Nature Communications

08 September 2023

細胞核運輸之外，細胞核運輸蛋白參與轉錄調控的非典型功能

蔡宜芳 TSAY, YI-FANG

Nature Plants

13 April 2023

植物光呼吸作用是無用的碳循環嗎？甘油酸轉運蛋白 NPF8.4 之研究發現光呼吸作用在”氮”循環上的新角色

薛雁冰 HSUEH, YEN-PING

Science Advances

18 Jan 2023

蠔菇藉由揮發性酮類麻痺及殺死線蟲

細生所（3）

許惠真 HSU, HWEI-JAN

過量膳食糖透過升高的活性氧誘導的 JNK 訊號損害果蠅成體幹細胞

陳振輝 CHEN, CHEN-HUI

Nature Physics

19 June 2023

跨領域合作在斑馬魚尾鰭發現「機械波」

高承福 KAO, CHENG-FU

Cell Reports

28 November 2023

表觀遺傳調控因子RNF20 調節新生心肌細胞極化的基因表達次序

植微所（5）

謝明勳 HSIEH, MING-HSIUN

The Plant Journal

23 November 2023

利用基因轉殖成功地增加稻米維生素B1的含量

賴爾珉 LAI, ERH MIN

mBio

6 March 2023

農桿菌第六型分泌系統於冠癭病發生及其微生物相的影響

賴爾珉 LAI, ERH MIN

EMBO Reports

17 April 2023

甘胺酸拉鍊序列幫助細菌效應蛋白質運送至目標細胞

顧銓 KU, CHUAN

Genome Biology

09 January 2023

地球最多的生物組織：從單一細胞探究植物木質部的發育與演化

馬麗珊 MA, LAY-SUN

Nature Communications

16 September 2023

玉米黑粉菌PR-1同源蛋白演化出兩個獨特具備雙重毒性活動的結構區域

基因體中心（4）

林國儀 LIN, KUO-I

Journal of the American Chemical Society

23 April 2023

寡醣癌症疫苗的抗原呈現機制及引發抗體交叉反應的特異性機制

莊樹諄 CHUANG, TREES-JUEN

Nucleic Acids Research

27 July 2023

整合第二與第三代定序精準偵測乳癌轉錄體中的分子間剪接RNA

對RNA-seq數據的分析經常觀察到相當數量的\"非線性\"（NCL）轉錄序列，這些轉錄序列包括拓撲上與參考基因體中相應的DNA序列不一致的序列片段。NCL轉錄序列可能來自分子間剪接、分子內後回向剪接(環狀RNA)、或DNA上的基因重排(基因融合)。在後轉錄過程中，分子間剪接發生在同一基因（基因內剪接）或不同基因（基因間剪接）間兩個或多個前信使核糖核酸分子（precursor mRNA）之間，並形成分子間剪接RNA（\"ts-RNA\"）。偵測分子間剪接事件經常會遭遇到偽陽性的干擾，這些偽陽性可能來自模稜兩可的序列比對、實驗中產生的人工假事件、環狀RNA、以及DNA上的基因重排。通常，NCL 事件是根據跨越NCL交匯點的第二代測序（SGS）的短序列比對而檢測到的。然而，如果觀測到的NCL兩端的剪接位點都來自相同的基因，則基於SGS的策略便很難有效地區分 ts-RNA 和環狀RNA。在此計劃中，基於第三代測序（TGS）技術生成的超長序列，我們提出了兩個特徵，跨出環狀序列和滾圈序列，用以區分這兩種類型的NCL轉錄序列。我們提出了一個流程，NCLscan-hybrid，利用結合來自MCF-7人類乳癌細胞的Illumina短序列與PacBio長序列策略來偵測高可信度的ts-RNAs，並提出一個可靠性指標來評估所預測的ts-RNA。為了確認已識別的基因內 ts-RNA，我們設計了一個具有多個實驗驗證步驟的實驗流程，以偵測並排除可能的偽陽性，包括RT實驗中產生的人工假事件、環狀RNA、以及DNA上的基因重排。我們進一步以CRISPR的技術，探討ts-RNA的生成。我們成功驗證位在NCL內含子的剪接位點兩端的反向互補序列（RCS）對ts-RNA生成扮演著重要的角色。我們繼續探討ts-ARFGEF1的功能與調控機制。我們實驗驗證降低ts-ARFGEF1的表現量會顯著抑制乳癌細胞的生長，降低ts-ARFGEF1的表現量會經由促進PERK/eIF2α/ATF4/CHOP訊息傳遞途徑方式激發細胞凋亡。這些結果顯示ts-RNA的調控在乳癌發展進程中的重要性。我們的研究可以增加我們對複雜的基因中ts-RNA事件的瞭解，除了提出一套有效區分ts-RNA 和環狀RNA這兩種NCL轉錄序列的預測流程，並首次揭示了內源性的ts-RNA的生成機制，以及ts-RNA在人類癌症發展進程中的調控角色。