教育訓練課程
- 主題 1 : 生物資訊系列課程
- 主題 2 :電子資源、資料庫、工具及書目管理軟體之使用教學
- -- 實體課程; -- 視訊課程
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8 月
9 月
02
CHINESE
【生物資訊系列】Gene annotation and orthology assignment for newly-sequenced organisms(In Chinese)(實體+線上課程)
2025-09-02(二)14:00~16:00
呂在明博士(研究助技師,細生所)
環境變遷大樓 6005 教室
2025-09-02(二)14:00~16:00
呂在明博士(研究助技師,細生所)
環境變遷大樓 6005 教室
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1. Databases (UniProt, Ensembl Metazoa, KEGG)
2. Sequence homology (BLAST, Diamond)
3. Blast2GO, OrthoFinder, and other tools
25
CHINESE
【生圖資源篇】活用 TAIR 於植物研究:阿拉伯芥與作物的實用工具(In Chinese)(實體+線上課程)
2025-09-25(四)10:00~12:00
陳荷明博士(副研究員,農生中心)
農科大樓 A133 會議室
2025-09-25(四)10:00~12:00
陳荷明博士(副研究員,農生中心)
農科大樓 A133 會議室
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阿拉伯芥 (Arabidopsis thaliana) 是研究最深入的模式植物,其龐大且高品質的資料與註解,不僅對阿拉伯芥研究者重要,對於其他植物,特別是作物研究同樣非常有價值。
本工作坊將介紹 The Arabidopsis Information Resource (TAIR) 這個線上平台,內容包含基因註解、序列資料、功能資訊以及多種實用研究工具。我們將著重於如何將 TAIR 的功能應用到非阿拉伯芥植物研究,例如作物基因的同源基因鑑定、功能預測與基因組特徵探索。
透過實際操作與示範,參加者將學習:
-
瀏覽 TAIR 網站與基因資訊頁面。
-
尋找同源基因及使用BLAST
-
利用基因組瀏覽器查看基因模型與多種高速定序資料。
完成本工作坊後,你將能更有信心地運用 TAIR 來支援自己的比較基因組學研究、功能預測以及實驗假說的建立。
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CHINESE
【生物資訊系列】Alternative-splicing detection by NGS
(In English)(實體+線上課程)
2025-09-30(二)14:00~16:00
林文鐽博士(研究副技師,植微所)
環境變遷大樓 6005 教室
2025-09-30(二)14:00~16:00
林文鐽博士(研究副技師,植微所)
環境變遷大樓 6005 教室
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1. definitions of detecting alternative splicing (AS),
2. theories of isoform-based algorithms,
3. theories of count-based algorithms,
4. quick walk-throughs of AS computation programs,
5. short discussions.